Era7 Bioinformatics: Google Summer Of Code

•Ubicación: Granada y Madrid, España. Además tiene una oficina subsidiaria en Cambridge, Massachusetts, Estados unidos desde 2012.

•Información general:
Era7 Bioinformatics es una compañía líder en Next Generation Sequencing (NGS) y Bioinformática para Genómica Bacteriana y Metagenómica. El modelo de negocio de Era7 se basa en ayudar a sus clientes en todas las fases de un de proyecto de genómica, desde el diseño del proyecto y la secuenciación al análisis bioinformático experto, la consultoría bioinformática especializada y el desarrollo de aplicaciones y software a medida. Esto es posible gracias a la fuerte actividad de investigación que Era7 desarrolla, al uso de Cloud Computing y a las ventajas de desarrollar software bajo un modelo de fuente abierta (Open Source).
Su equipo incluye bioinformáticos, matemáticos, desarrolladores de software, bioquímicos, biotecnólogos y médicos. Un equipo multidisciplinar , que cuenta también con investigadores con experiencia en múltiples campos capaces de integrar diversos tipos de conocimiento.
Participan en varios proyectos de investigación y lideran proyectos propios como BG7 o Bio4j. Muestran gran pasión por las secuencias y las nuevas tecnologías.

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•Programa ofrecido y descripción:
-Google Summer of Code: Google Summer of Code es un programa global que ofrece financiación a proyectos líderes de Open Source de todas las áreas del conocimiento. Este programa financia directamente a estudiantes de todo el mundo para ayudar en el desarrollo de nuevas funcionalidades o mejoras de los proyectos Open Source seleccionados. Google intenta identificar y financiar proyectos interesantes como Bio4j de Era7 Bioinformatics.
Bio4j es un proyecto de Oh no sequences!, el grupo de investigación de Era7 Bioinformatics. Bio4j es una plataforma bioinformática de grafos, de alto rendimiento y open source, que integra los datos disponibles en las bases de datos abiertas más representativas de información proteica. Incluye Uniprot, KB, (SwissProt + Trembl), Gene Ontology (GO), UniRef (50, 90, 100), RefSeq, NCBI taxonomy, y Expasy Enzyme DB. La versión actual tiene más de 2.000.000.000 de relaciones, 400.000.000 de nodos y 1.000.000.000 de propiedades. Bio4j proporciona un entorno completamente nuevo y potente para el querying y manejo de información relacionada con las proteínas. Dado que se basa en un motor gráfico de alto rendimiento, los datos se almacenan de una forma que semánticamente representa su propia estructura. Al contrario, las tradicionales bases de datos relacionales deben aplanar los datos que representan en tablas, creando identificadores artificiales para conectar las distintas tuplas; que pueden en algunos casos conducir a modelos de dominio que tienen poco que ver con la estructura real de los datos.

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•Requisitos:
Los candidatos al programa deberán ser:
•Estudiantes universitarios matriculados en centros de educación un universitaria.
•Estudiantes universitarios que no hayan finalizado su licenciatura (o equivalente) antes de participar en el Programa.
Los candidatos al programa deberán presentar asimismo:
•Un currículo destacado de resultados académicos.
•Interés por hacer un doctorado en investigación.
•Es fundamental que los estudiantes tengan un dominio suficiente del idioma inglés para que puedan participar en la experiencia de investigación en los laboratorios científicos, así como para participar en el simposio del programa.

•Información adicional:
•El número de plazas ofertadas dependerá de la disponibilidad de cada programa, para poder ofrecer una atención adecuada al alumno.
•Se trata de un programa de prácticas no remunerado.
•Al finalizar el periodo de prácticas, Era 7 Bioinformatics expedirá una certificación con mención expresa del nivel alcanzado por el alumno, con indicación de la especialidad a que ha estado orientada su formación.

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